Es árbitro de la Cámara de Comercio de Santiago desde 1998 hasta la actualidad, habiendo actuado en más de 80 casos, incluyendo arbitrajes ad-hoc. En el ámbito del arbitraje internacional, Juan Eduardo tiene una vasta experiencia como Presidente y coárbitro en casos CCI relacionados principalmente con contratos EPC de construcción de una planta de bioetanol en Uruguay y una planta de gas biodiesel en Argentina; un Contrato de Subconstrucción de una Planta Termoeléctrica, en el Norte de Chile; un Contrato de Fabricación, Transporte y Montaje de Campamento, Proyecto Hidroeléctrico, ubicado en la zona cordillerana del Maule, Chile; un contrato de construcción entre una empresa eléctrica chilena y un proveedor de equipos italiano, para dos grandes plantas solares en el desierto chileno, y un proyecto de carretera en Bolivia ante la Cámara de Comercio de Bolivia. Igualmente se ha desempeñado como árbitro internacional de la ICDR en temas de concesiones de carreteras en Colombia y como árbitro internacional de la Cámara de Comercio de Lima, en temas de construcción. También es miembro de la lista de Árbitros de CCBC Brasil, FIESP y CAMFIEP, AMCHAM Perú y Universidad Católica Lima.

Se ha desempeñado como Presidente en 4 Dispute Boards relacionados con proyectos de construcción minera en Chile. Es Profesor de Derecho de la Universidad de los Andes, Chile, desempeñándose como Director Académico a cargo de estudios de postgrado en derecho de construcción y de derecho inmobiliario; profesor de  arbitraje internacional para el Heidelberg Center en América Latina. Es Presidente de la Comisión de Legislación de la Cámara Chilena de la Construcción. Juan Eduardo tiene una maestría en Derecho Internacional, Arbitraje Internacional e Inversiones de la Universidad de Heidelberg, Alemania. Es igualmente  miembro del CIArb, Chartered Institute of Arbitrators, de la Academia Internacional de Abogados de la Construcción y del Club Español e Iberoamericano del Arbitraje.